Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms