Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp5Q8BX09 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms