Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm4aQ8BW72 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm4aQ8BW72 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm4aQ8BW72 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm4aQ8BW72 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms