Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms