Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd4Q8BH32 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms