Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms