Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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