Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms