Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ttc28Q80XJ3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ttc28Q80XJ3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ttc28Q80XJ3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ttc28Q80XJ3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ttc28Q80XJ3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ttc28Q80XJ3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ttc28Q80XJ3 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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