Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms