Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp8Q80U87 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp8Q80U87 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp8Q80U87 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp8Q80U87 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp8Q80U87 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp8Q80U87 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp8Q80U87 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp8Q80U87 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp8Q80U87 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp8Q80U87 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp8Q80U87 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp8Q80U87 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp8Q80U87 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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