Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms