Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms