Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LnpkQ7TQ95 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms