Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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