Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms