Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms