Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cachd1Q6PDJ1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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