Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BC061212Q6P8K3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms