Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q6DFW0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms