Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Pkp4Q68FH0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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