Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms