Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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