Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms