Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms