Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc18Q640L5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms