Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms