Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf6Q62311 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms