Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sox19Q62249 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms