Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sycp1Q62209 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sycp1Q62209 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sycp1Q62209 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sycp1Q62209 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sycp1Q62209 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sycp1Q62209 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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