Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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