Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms