Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms