Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r1bQ60829 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r1bQ60829 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms