Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms