Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms