Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms