Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps54Q5SPW0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps54Q5SPW0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms