Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms