Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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