Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm29609Q3UU56 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm29609Q3UU56 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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