Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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