Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms