Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms