Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms