Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ulk3Q3U3Q1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ulk3Q3U3Q1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ulk3Q3U3Q1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ulk3Q3U3Q1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms