Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms