Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21440Q3TTD8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms