Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rtl9Q32KG4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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