Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cpne9Q1RLL3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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